Доктор исторических наук, профессор, ведущий научный сотрудник Института российской истории РАН, главный редактор журнала «Российская история», главный редактор журнала «Историк и художник», член организационного комитета междисциплинарного научного семинара по истории взаимовосприятия культур Россия и мир.
Окончил Симферопольский государственный университет им. М. В. Фрунзе, учился в аспирантуре Института Истории СССР АН СССР. В 1984 году защитил в Университете дружбы народов им. П. Лумумбы кандидатскую диссертацию «Русская революционная демократия 60-70-х годов XIX в. в освещении современной французской буржуазной историографии». Докторская диссертация: «Русский либерализм: от 40-х к 80-м годам XIX в. (идеи, люди, среда)» (1999 г.). С 1982 года преподавал в Московском государственном заочном педагогическом институте, Московской Высшей партийной школе, Российском государственном гуманитарном университете, Государственном университете гуманитарных наук, Московском государственном областном университете. В 2004 году получил звание профессора. В 2004 году Сергей Сергеевич Секиринский создал журнал «Историк и художник», выходивший до 2008 года. C 2011 трудился в Центре по изучению отечественной культуры Института российской истории РАН. С 1987 года по 2011 год учёный работал в редакции журнала «История СССР» — «Отечественная история» — «Российская история». Весной 2012 года избран на должность главного редактора журнала «Российская история».
Похоронен 10 ноября 2012 г. на Даниловском кладбище.