Окончил Орджоникидзевское высшее военное командное училище.
До 1997 года проходил службу в Вооруженных силах.
С 2000 года директор НПФ «Сберегательный», один из учредителей фонда стало правительство Ленинградской области.
С 2005 по 2011 год вице-губернатор Ленинградской области, руководитель аппарата.
С 2011 года вице-губернатор Санкт-Петербурга.
Мастер спорта по многоборью.
Декларация
супруга Сергея Козырева владеет земельным участком, домом и другими постройками в Финляндии. В собственности Козырева — две моторных лодки Buster.