Мораис — первый президент Бразилии, избранный путём всенародного голосования, и первый президент Бразилии гражданской профессии (адвокат). Срок его правления отмечен восстанием Канудос (1893 — 1897), жестоко подавленным бразильской армией. Кроме того, ему пришлось решать такие неотложные задачи внешней политики, как уточнение границ с Аргентиной, восстановление дипломатических отношений с Португалией, отражение территориальных притязаний Англии.
В 1889 — 1890 гг. занимал пост губернатора штата Сан-Паулу, затем стал сенатором и с 1891 по 1894 гг. был вице-спикером. Город Президенти-Пруденти в штате Сан-Паулу назван в его честь.
Пруденти ди Мораис родился в районе Иту (штат Сан-Паулу) 4 октября 1841 года. В 1863 году окончил Школу права в Сан-Паулу. В этом же году переехал в Пирасикабу, где в течение двух лет занимался адвокатской практикой.
В 1865 году началась политическая карьера де Мораиса. Он вступил в Либеральную партию и был избран членом городского муниципалитета Пирасикабы. В 1873 году перешёл в Республиканскую партию.
1 марта 1894 года в Бразилии состоялись первые президентские выборы. Победу на них одержал Пруденти ди Мораис. Он набрал 276583 голоса и опередил своего главного соперника — Афонсу Пена. 15 ноября новоизбранный президент вступил в должность.
В 1893 году на северо-востоке штата Баия зародилось движение Канудос. Забытое правительством и доведенное до отчаяния бедностью и голодом население этих провинций встало под знамёна человека, прозванного Антониу Консельейру. Вокруг него собралось около 20-25 тысяч человек из штатов Баия, Сеара, Пернамбуку, Сержипи. Они начали грабить проезжих торговцев и местных помещиков. Правительство штата Баия пыталось восстановить порядок, несколько раз посылало отряды полиции, каждый раз увеличивая их численность, но повстанцы одерживали победу за победой, забирая себе трофейное оружие и боеприпасы.
В конце концов в ситуацию пришлось вмешаться республиканскому правительству. Оно не стало вдаваться в социальные корни и цели движения, объявило его участников врагами Республики и демократии. Войска, включая тяжелую артиллерию, были посланы на борьбу с ними. В 1897 году после продолжительных боёв восстание было подавлено. Правительственные войска потеряли 4000 человек убитыми, количество погибших повстанцев было намного больше.