Сын царя Алексея Михайловича от первого брака с Марьей Ильиничной Милославской, дочерью боярина Ильи Даниловича Милославского и женъ1 его Ксении, известной только по имени.
Родился в Москве 8 июня 1656 г.; вступил на престол 30 января; коронован 18 июня 1676 г.; возобновил московскую Славяно-греко-латинскую академию и, приняв в подданство запорожцев, возвратившихся от Турции, должен был начать с Магометом IV, султаном турецким, войну, ознаменованную славной защитой Чигирина казаками, в 1677 г.;
продолжал войну с турками, снова не успев шими под Чигирином, и заключил мирный трактат с Польшей, которой возвращены Себеж, Невель и Велижь, в 1678 г.; указал ярмарке в Архангельске быть бессрочною, в 1679 г.; ратификовал Бахчисарайский трактат с Турцией и Крымом, заключенный на 20 лет, 3 января 1681 г.; уничтожив сожжением Разрядных книг местничество 12 января, умер в Москве 27 апреля 1682 г.
Тело его погребено в московском Архангельском соборе.
Царь Федор 3 был женат дважды: 1) на Агафье Семеновне Грушецкой (см. 4); 2) на Марфе Матвеевне Апраксиной (см. 135), и от первого брака имел сына Илью, который жил всего один день, в 1681 г.