Егор Яковлев родился в Москве. Закончив Московский историко-архивный институт, он начал работать в многотиражке, после чего перешел в редакцию "Московской правды". В первой половине 1960-х годов Яковлев работал специальным корреспондентом, а затем - заместителем главного редактора газеты "Советская Россия".
В 1966 году Яковлев занял должность главного редактора журнала "Советская печать", который позднее получил новое название - "Журналист". В 1968 году Яковлев перешел в "Известия", где проработал четыре года специальным корреспондентом. После трехлетнего перерыва, связанного с работой в Праге, он вернулся в "Известия" еще на 11 лет. В 1985-1986 годах Яковлев был собственным корреспондентом "Известий" в Чехословакии.
В 1986 году Яковлев стал заместителем председателя правления Агентства печати "Новости" (АПН) и главным редактором "Московских новостей". Осенью 1990 он добился независимости газеты от АПН. В 1991-1992 годах Яковлев занимал должность председателя Всесоюзной телерадиокомпании (ВТРК), которая во время его работы была переименована в Российскую телерадиовещательную компанию "Останкино".
В декабре 1992 Яковлев был назначен генеральным директором издательского объединения "РТВ-Пресс". Вскоре он приступил к изданию "Общей газеты", которая начала выходить с весны 1993 года. В 2002 году Яковлев продал "Общую газету".
За свою работу Егор Яковлев был удостоен международных премий "Лучший журналист Европы" и "За правдивость в журналистике".