Известен своей ролью в телесериале «Звездный Путь: Следующее поколение - Star Trek: The Next Generation».
Джонатан вырос в небольшом американском городке с библейским названием Вифлием. История умалчивает, был ли он ангелом ;), но немаленький рост (193 см) и бесшабашный нрав не сделали его вечным рабом американского футбола и не помешали с успехом закончить сначала университет штата Пенсильвания, а затем престижный Гарвард. Несколько сезонов он провел в Loeb Drama Centre, а позже начал свою актерскую карьеру в Нью-Йорке, где выступал на сцене бродвейских театров. Перед тем, как получить роль героического первого офицера Райкера в киноэпопее "Звездный Путь", Джонатан был занят в нескольких сериалах, таких как: "Falcon Crest" (1981), "Bare Essence" (1982), "Paper Dolls" (1984), "The Doctors" (197
7). Из прочих его телевизионных опытов русский зритель мог видеть только "Ангелов Чарли" (1976), "Семейство Харт" (1979) и "Женаты, с детьми" (1987). Также Фрейкс играл в гремевшем некогда на просторах тогда еще СССР сериале про американскую гражданскую войну "Север и Юг" (1985), где был партнером Патрика Свейза и Джеймса Рида.
После 7 лет в качестве коммандера "Энтерпрайза-Д" Уильяма Райкера Джонатан плавно перешел из рядов актеров в гильдию режиссеров. Потренировавшись на съемках нескольких эпизодов различных сериалов саги "Звездный Путь", Джонатан снял два полнометражных фильма по мотивам легендарного сериала, "Первый контакт" (1996) и "Восстание" (1998). Кроме этого, на данный моме
нт им в качестве режиссера созданы такие художественные фильмы, как: "Останавливающие время" (2002), "Предвестники бури" (2004), "Библиотекарь 2: Возвращение к копям Соломона" (2006).
Также мистер Фрейкс являлся продюсером нескольких известных проектов, таких, как "Розвелл", и был режиссером видеоигры. Его голосом говорит мультипликационный персонаж Ксанатос из сериала Гаргульи, он участвовал в записи музыкального альбома в качестве тромбониста в альбоме Phish Hoist и был несколько сезонов ведущим телешоу Beyond Belief: Fact or Fiction .
За оригинальную манеру cъемок получил прозвище Two Takes Frakes, потому что ограничивался малым против обычного количеством дублей