Когда Джону Брауну было 12—13 лет, отец послал его вместо себя гуртовщиком в действующую армию.
Джон Браун родился 9 мая в Торрингтоне (Коннектикут). Он был вторым сыном Оуэна Брауна (1771—1856) и Рут Миллс (1772—1808) и внуком капитана Джона Брауна (1728—1776). Некоторое время считалось, что он был тем же Джоном Брауном, который во время Американской революции был лоялистом и сидел в тюрьме с печально известным Клавдием Смитом (1736—1779) (предположительно за кражу рогатого скота, который шёл на содержание голодающих британских войск). Однако это не соответствует ни истории семьи Браунов, ни записям о семье Хамфри, с которой Брауны находились в родстве (Хамфри была бабушкой аболициониста Джона Брауна по материнской линии). В 1857 г. Джон Браун написал автобиографическую записку, согласно которой и его дед, и дед его первой жены были солдатами Континентальной армии. Это находит подтверждение и в книге «Семья Хафри в Америке» (1883), где упомянут дед Брауна.
В 1805 г. семья переехала в штат Огайо. Брауны поселились в Хадсоне. Здесь семья занялась скотоводством, Джон сторожил стадо. По совету индейцев, с которыми Брауны поддерживали дружеские взаимоотношения, Оуэн Браун стал заниматься дублением кож, что оказалось выгодным.
Когда Англо-американская война 1812—1814 гг. окончилась, Джон Браун вернулся домой и решил поступить в школу. В возрасте 16 лет Джон Браун уехал в Плейнфилд (Массачусетс) и поступил в школу. Вскоре он перешёл в академию в Личфилде (Коннектикут). Он надеялся стать конгрегационалистским священником, но у него закончились деньги; кроме того, у Джона началось воспаление глаза. Это вынудило его бросить академию и вернуться в Огайо. Здесь вместе со своим братом Леви он открыл собственную кожевенную мастерскую, которая поначалу приносила солидный доход.21 июня 1820 г. Браун женился на Дайант Ласк. Их первый ребенок, Джон-младший, родился 13 месяцев спустя. Весной 1825 г. Браун и его семья переехали в Кроуфорд, селение близ Ричмонда (Пенсильвания). Здесь Джон купил участок площадью 200 акров (более 800 000 м²). Он очистил одну восьмую участка, построил дом, сарай и кожевенную мастерскую, а затем нанял 15 человек для работы. Также он пытался заработать, разводя крупный рогатый скот и занимаясь межеванием. Но дела шли плохо, и Брауну пришлось стать почтальоном. Несмотря на эти трудности, Браун пытался организовать школу для негров, чему активно противодействовали местные власти.
В 1831 г. один из его сыновей умер. Браун заболел, а его долги всё росли. Летом 1832 г., вскоре после смерти новорождённого сына, Дайант умерла от воспаления мозга. В это же время дом Брауна стал пристанищем для беглых негров, которых после восстания Ната Тёрнера становилось всё больше и больше.
14 июня 1833 г. Браун женился на шестнадцатилетней Мэри Энн Дэй (1817—1884). В конечном счёте у них было тринадцать детей, не считая ещё семи от предыдущего брака.
В 1836 г. семья Браунов перееехала в Огайо к Фрэнклину Миллсу. Там Браун получил ссуду на покупку земли. Он понес большие денежные потери в ходе экономического кризиса 1837 г. и однажды был даже заключён под стражу. Брауну нужно было не только расплачиваться с долгами, но и кормить семью. Поэтому он перепробовал много различных способов заработка: Браун занимался дублением кожи, торговлей скотом и овечьей шерстью, коневодством, пас овец. Тем не менее, 28 сентября 1842 г. Джон Браун был объявлен банкротом. В 1843 г. четверо из его детей умерло от дизентерии.
один из первых белых аболиционистов, защищавших партизанскую борьбу и практиковавших её с целью отмены рабства. Сначала Браун привлёк внимание общества, когда он командовал отрядом добровольцев, воевавшим в Канзасе и участвовавшим в двух генеральных сражениях против южан, выступавших за рабство. Джон Браун руководил резней в Потаватоми 24 мая 1856 и освободил 11 рабов в соседнем штате Миссури. Самым известным подвигом Брауна цвета был набег, в ходе которого был захвачен правительственный арсенал в Харперс-Ферри (в современной Западной Виргинии). Последующий захват Брауна правительственными войсками, которыми командовал Роберт Ли, суд над ним и казнь Брауна считаются одной из важных предпосылок Гражданской войны в США, которая началась шестнадцать месяцев спустя. Песня «Тело Джона Брауна» стала походной песней северян.