Российский футболист, полузащитник футбольного клуба «Томь».
Дебютировал в 17 лет в первом дивизионе за красноярский «Металлург». Перейдя в «Томь», внёс значительный вклад в её выход в премьер-лигу в 2004 году, забив в том сезоне 6 голов и сделав 10 голевых передач. В том же сезоне он получил приглашение в «Сатурн», где стабильно выходил в основном составе при Александре Тарханове, а позднее и Владимире Шевчуке.
С приходом Владимира Вайсса на пост главного тренера «Сатурна» Александру удалось лишь дважды выйти в основном составе, что стало причиной его перехода на правах аренды в «Химки». Вернувшись в 2007 году в «Сатурн», он был вынужден пропустить сезон из-за травмы. А постоянно появляться на поле стал лишь во второй половине сезона 2008 года.
Вернувшись на правах аренды в «Томь» в 2008 году, он подписал с клубом трёхгодичный контракт в январе 2009 года. Игрок основного состава томской команды.
В заключительном матче Чемпионата России по футболу 2010 года против «Ростова» оформил первый в карьере дубль.
В первый сезон выступления в «Сатурне» своей игрой привлек внимание главного тренера молодежной сборной России Андрея Чернышова. Дебют в молодежной сборной состоялся 26 марта 2005 года в товарищеском матче против «Санкт-Галлена» (3:3), в этом матче Александр вышел на поле в основном составе и сыграл 55 минут.
Первым официальным матчем для Харитонова в молодежной сборной стала игра против сборной Эстонии (в котором Россия победила 5:1) в рамках отборочного турнира Чемпионата Европы 2006 года. Всего Харитонов провел 4 матча за молодежную сборную России.