Родился в небольшой деревне в Бельгийских Арденнах с населением около 800 человек, основную часть которого составляли фермеры. Единственная школа располагалась в километре от деревушки на окраине леса. Как впоследствии Клод писал в автобиографии «фактически школа представляла собой небольшое здание, в котором была одна единственная комната с камином, дрова и уголь для которого заготавливал сам учитель.
В этой комнате одновременно занималось около 50 учеников в возрасте от 6 до 11 лет». Несмотря на то, что все предметы преподавались одновременно одним и тем же педагогом, результаты такого обучения оказались блестящими.
В период предвоенной депрессии умерла мать и отец решил перебраться в Атюс, процветающий сталелитейный регион на границе Франции и Люксембурга. Через два года на семейном совете было решено, что Клод должен вернуться в Лонлиер помогать парализованному дяде. Ему было всего 13 лет, но пришлось не только ухаживать за лежачим больным, но и взять на себя все работы по дому. Единственный контакт с внешним миром – пожилой врач, которого ему приходилось вызывать в неотложных случаях.
В Первую мировую войну он записался добровольцем в британскую разведку. После окончания войны сначала поступил в горнорудную школу, а потом – в медицинскую школу при Льежском университете. В 1928 закончил, получив докторскую степень. Зимой 1928–1929 он учился в аспирантуре в Берлине, сначала в Институте рака, а потом в Институте Кайзера Вильгельма в Далеме, в лаборатории, руководимой профессором Альбертом Фишером. Его докторская диссертация была посвящена пересадке опухолевых клеток мышей крысам.
В конце 1920-х этимология такого заболевания как рак была совершенно не изучена. Некоторые ученые полагали, что болезнь вызывается бактериями, другие считали, что заболевание имеет вирусную природу.
Клод разработал программу исследования рака и направил ее директору Рокфеллеровского института медицинских исследований в Нью Йорке. Он предлагал проверить теорию вирусной природы заболевания на конкретном случае саркомы Роуса. Саркома Роуса – раковое заболевание у кур, веретеноклеточная саркома, образованная соединительной тканью и типичными для сарком перерожденными клетками в виде веретена. Заболевание впервые было описано американским патологом Пейтоном Роусом, (лауреат Нобелевской премии по физиологии и медицине, 1966).
В то время Рокфеллеровский институт возглавлял Саймон Флекснер, который прислал Клоду приглашение, и, получив стипендию, Клод уезжает в Соединенные Штаты работать в Рокфеллеровском институте.
Основная стоящая перед ним задача – отделить онкогенный фактор (фактор, вызывающий перерождение нормальных клеток тканей организма в опухолевые), для ее решения он разработал метод клеточного фракционирования с помощью центрифуги.
Через несколько лет ему удалось выделить онкогенный фактор из опухолевых клеток. Выделенный фактор вводился группе подопытных животных, после чего изучалась частота возникновения заболевания у этой группы, в сравнении с контрольной. Полученные результаты доказали, что выделенный фактор вызывает рост раковых клеток. Дальнейшие исследования онкогенного фактора показали, что он состоит из рибонуклеиновой кислоты, которая, как уже было установлено, входит в состав вирусов. Это было первое косвенное доказательство связи между вирусами и возникновением заболевания.
Далее Клод применил разработанный им метод клеточного фракционирования для изучения здоровых клеток. Ему удалось отделить клеточное ядро от цитоплазмы, а серия дополнительных экспериментов позволила выделить отдельные элементы цитоплазмы, в том числе органеллы и митохондрии органоиды цитоплазмы животных и растительных клеток в виде нитевидных или гранулярных образований, состоящие из белка, липидов, РНК и ДНК.
В 1943 он определил, что в здоровых клетках также присутствуют частицы, содержащие рибонуклеиновую кислоту. Эти частицы он назвал микросомами, позже они были переименованы в рибосомы. Еще позже было установлено, что основной функцией рибосом является биосинтез белка.
После этого Клод занялся изучением функции митохондрий и в 1945 опубликовал полученные результаты: выяснилось, что основная функция митохондрий – выработка энергии.
В начале 1940-х ему представилась уникальная возможность изучать клетки с помощью электронного микроскопа и через три года он получил первые фотографии, сделанные при помощи электронного микроскопа. В 1946 он опубликовал статью, посвященную микроскопической анатомии клетки
После войны, в 1949 он возвратился на родину, в Бельгию и через год стал директором Института имени Жюля Борде.
В 1971 ушел на пенсию и стал директором лаборатории клеточной биологии и онкологии Католического университета в Лувене.
В 1974 Клод (вместе с Кристианом Де Дювом и Джорджем Э. Паладе) стал лауреатом Нобелевской премии по физиологии и медицине «за открытия, касающиеся структурной и функциональной организации клетки».
Среди наград: премия Луизы Гросс-Хорвиц (Колумбийский университет, 1970), Большая лента ордена Леопольда II, присуждаемаяй бельгийским правительством.
Член Французской медицинской академии, Бельгийской медицинской академии, Американской академии искусства и науки.
Сочинения: Fractionation of Chiken Tumor Extracts by Highspeed Centrifugation «American Journal of Cancer» (1930); Fractionation of Mammalian Liver Cells by Differerntial Centrifugation. I and II. «Journal of Experimental Medicine» (1946).