Получал школьное образование в Джовхаре, а затем – в столице Сомали – Могадишо. Изучал арабский язык и географию в университете суданской провинции Курдуфан, и право в Ливии.
Шейх Шариф Шейх Ахмед родился 25 июля 1964 года в предместье города Махаддай в северной части Сомали . Получал школьное образование в Джовхаре, а затем – в столице Сомали – Могадишо. Изучал арабский язык и географию в университете суданской провинции Курдуфан, и право в Ливии.
С 1991 года в Сомали идет гражданская война, и столица неминуемо становится центром противостояния, что провоцирует в городе всплеск преступности. При поддержке местного населения Шариф Ахмед создает районный шариатский суд и становится его председателем. После Шариф Ахмед и его единомышленники разворачивают кампанию по борьбе с преступностью уже на уровне всей столицы. В июле 2004 года возникает Совет исламских судов Сомали (SICC, известный также как Союз исламских судов - UIC), который опять возглавляет Шариф Ахмед. И, хотя сам Шариф Ахмед придерживается весьма умеренных позиций, в организации оказывается большое количество радикально настроенных исламистов, многие из которых подозреваются в террористической деятельности. По мнению США, Сомали превращается в региональный центр деятельности «Аль-Каеды».
Движение SICC набирает влияние, и вскоре устанавливает контроль над Могадишо, а также над центральной и южной частью страны.
В 2006 году в Сомали разгорается военный конфликт, в котором сторонники Шейха Ахмеда, которых можно уже называть боевиками, противостоят временному правительству, а также Эфиопским войскам, которые оказывает поддержку противной стороне. К началу 2007 года правительственные войска и эфиопские военные вытесняют исламистов из столицы и с большинства других занятых ими позиций.
8 января 2007 года в конфликт вмешиваются США и наносят удары по позициям боевиков на юге Сомали.
22 января того же года Шариф Ахмед сдается на кенийско-сомалийской границе властям Кении, однако уже спустя несколько дней он освобожден и выезжает из Кении в Йемен. В июле 2007 года он отказывается принять участие в примирительной конференции.
В сентябре 2007 года сомалийская оппозиция создает «Альянс за освобождение Сомали», Его возглавляет Шариф Ахмед. От имени «Альянса» он подписывает с правительством соглашение об отказе от любого вооруженного противостояния в течение трех месяцев.
В ноябре 2008 года, Шариф Ахмед возвращается в Сомали, в котором по-прежнему продолжается противостояние правительства и исламистов. Именно тогда Шариф Ахмед совершает политически правильный ход: он предлагает заменить эфиопские войска, находящиеся в стране на международные миротворческие силы. Политическая популярность Шарифа Ахмеда растет, и в январе 2009 года в парламент Сомали попадает 149 представителей «Альянса».
31 января после прошедшего за пределами страны, в Джибути, голосования в сомалийском парламенте стало известно, что Шариф Ахмед стал новым президентом Сомали.